A l’aube de la Seconde Guerre mondiale, pendant l’automne 1937, le lieutenant-colonel Yuki de l’armée impériale met en place dans le plus grand secret l’Agence D, un organisme formant des espions. Contrairement aux jeunes hommes qui intègrent l’armée dans un esprit nationaliste, les personnes recrutées sont des génies universitaires. Ils sont formés à manier les explosifs, les communications sans fil, à conduire des véhicules ou des avions, et surtout à recueillir de précieuses informations. Tuer ou se suicider fait partie des options de ces agents, pour qui la discrétion reste le maître mot. Nous suivons les missions à haut risque de ces jeunes recrues dont l’intrépide génie Kato…