En raison de ses mauvaises notes, Tsukune Aono, n'a pas réussi à intégrer un des lycées de son choix. Par accident, une seul école l'accepte, qui n'a rien d'ordinaire. Cette école s'avère être fréquentée par des "Youkai" (Monstre) déguisés en humains. C'est alors qu'il rencontre Akashiya Moka, une belle jeune fille qui est en fait un vampire; craignant pour sa vie il tente de s'échapper du lycée. Donc Tsukune est obligé de rester dans l'académie en cachant sa nature d'humain aux autres étudiants et enseignants. Cependant, lors d'une "dispute", Tsukune découvre la vraie nature de Moka en arrachant le rosaire qu'elle porte autour du cou.