MacGyver è un agente della Phoenix Foundation, un non precisato organo governativo che opera in vari campi e le cui missioni sono spesso top-secret. MacGyver è un agente atipico: detesta le armi, è altruista, positivo, non fuma e non fa uso di alcolici, è dotato di un certo humour e sa sacrificarsi per gli amici, ai quali cerca sempre di dare il buon esempio. La sua preparazione in campo scientifico gli consente di creare vari espedienti geniali con cui se la cava in ogni situazione. Due dei migliori amici di "Mac" sono Peter Thornton, capo di MacGyver alla Phoenix, e Jack Dalton, un pilota che si mette spesso in guai che MacGyver deve ogni volta risolvere. Il più acerrimo nemico di MacGyver è invece Murdoc, assassino di professione, che cercherà di ucciderlo molte volte, senza però mai riuscirci.