Im Jahr 2065 steht die Menschheit in Kontakt mit außerirdischen Zivilisationen, die in den Tiefen des Ozeans leben. Die Aquanauten der internationalen WASP-Marine unter der Leitung von Troy Tempest auf dem U-Boot „Stingray“ vereiteln die Angriffe der feindlichen Schiffe. Generell bekämpft das Team um Troy, das noch aus Phones, Marina und Atlanta besteht, Piraten, Verbrecher und feindlich gesinnte Lebewesen.