En los confines de la Vía Láctea en el planeta Zi existe formas de vida metálicas que poseen habilidades de combate superiores. Estos son los Zoids. Guerreros por naturaleza. Zoids se han utilizado como las armas definitivas en una guerra en curso entre las fuerzas imperiales y los republicanos del planeta Zi. La primera serie es del siglo caótico. La primera parte tiene lugar durante la guerra entre los dos grandes naciones de Zi: el Imperio y la República. En este caos entra tres vidas conectados diferentes: Van Flyheight, un joven republicanos que tropieza con algunas ruinas antiguas; Zeek, un organoides en las ruinas que tiene la capacidad de revivir y mazimize el potencial de Zoids; y Fiona, una antigua Zoidian despertado de su sueño y que ahora acompaña a Van en su viaje hacia el destino. Con la ayuda de la excéntrica Dr. D, el mercenario Irvine, y el Moonbay independiente entre otros, Van encuentra inadvertidamente hims