Bach et Bottine raconte l'histoire d'une orpheline de 11 ans, Fanny, une enfant étonnante et douée d'un prodigieux sens de la vie. De son passé, il ne lui reste que sa seule amie, Bottine, une mouffette apprivoisée. Un jour, elle devra aller habiter chez son oncle. Elle sème alors le désordre dans l'existence bien ordonnée de cet oncle comptable, un vieux garçon au coeur tendre dont l'unique passion est la musique de Bach.