« LOST » est une « ligne temporelle alternative de l'histoire » qui progresse simultanément à celle de Duel Masters Win. Le manga Duel Masters LOST Tsuioku no Suishô dépeint un monde encore jamais vu auparavant.Il suit in Kirifuda, âgé de seize ans (l'antagoniste de l'anime Duel Masters Win), alors qu'il a tout perdu. Il est alors entraîné dans un combat pour regagner le monde qu'il a autrefois désiré.