Ogni mattina, alle 8 in punto, il Presidente degli Usa riceve un rapporto sulle attività che possono minacciare la sicurezza degli Stati Uniti, sia che provengano dall’interno o dall’esterno del Paese. Questo rapporto si chiama Codice Matrix. Per combattere ogni attività ostile, il Presidente, attraverso il Dipartimento per la Sicurezza Nazionale, ha creato una speciale task force di agenti speciali. Leader della squadra è John Kilmer (James Denton, il fascinoso sedicente idraulico Mike Delfino di Desperate Housewives). Ex agente dell’FBI, Kilmer ha avuto dalla Casa Bianca il pieno accesso ai più moderni ritrovati tecnologici in materia di armi, comunicazioni e altri mezzi utili per le indagini, oltre che la collaborazione degli agenti dell’FBI, dell’NSA e della CIA. Il suo diretto superiore, oltre al Presidente, è il colonnello Roger Atkins (Will Lyman). Il suo vice è invece la sua ex moglie, l’agente speciale Frankie Ellroy-Kilmer (Kelly Rutherford, attrice di Melrose Place), una giovane donna dall’alto profilo professionale e abilissima nello smascherare i nemici più insidiosi. Completano il team l’agente Mo (Anthony Azizi), di origine egiziana e un tempo nell’organico della CIA, Lia “Lark” Larkin (Melora Walters), scienziata forense, e Jelani (Mahershalalhashbaz Ali), afroamericano genio dei computer e vero asso nell’intercettare segnali radio, fax e telefonici provenienti da qualsiasi parte del mondo.