平凡に暮らしていた女子高校生・加納 渚は、テスト中に幻影を見てからというもの、不気味な怪物の襲撃を受けるようになった。遂には、両親までもが恐ろしい姿に変容し、渚に襲いかかる。そこに謎の少女・イクサー1が助けに現れた！理由も解からぬうちにイクサー1のパートナーに指名された渚は、彼女とともにイクサーロボに乗り込み、宇宙からの侵略者クトゥルフの戦闘下士官コバルトの操る巨大ロボ・ディロスθと対決！しかし、手も足も出ない。大ピンチを迎えるイクサー1と渚。その時、イクサー1が放った一言が渚の秘められたパワーを呼び覚ました！