種麹屋の次男坊である沢木 惣右衛門 直保（さわき そうえもん ただやす）は、菌やウィルスを視認し会話ができるという不思議な能力を持っていた。直保は幼馴染の結城とともに、祖父の友人である樹慶蔵が教授を務める「某農業大学」へと入学する。二人は、院生の長谷川遥と、ゼミ生の武藤葵の他、密造酒の製造に失敗して多額の借金を背負うことになった2年の美里と川浜 、偶然ゼミに参加することになった1年の及川 葉月を加えた8人は、菌とウィルスに纏わる様々な騒動に巻き込まれてゆく。