리브라 공방전으로부터 1년 후인 애프터 콜로니 196년, 지구권 통일 정부의 수립으로 인한 첫 번째 대통령이 당선된 후 지구권에선 무기가 사라져 더이상의 분쟁은 일어나지 않게 되었다. 하지만 대통령 직속으로 분쟁의 기미를 조사하고 사전에 방지하는 유일한 무력기관 '프리벤터'는 '13번째 성좌'라는 암호코드와 함께 모빌슈트의 재료인 네오 티타늄 합금이 제조된 흔적을 발견한다. 한편 콜로니 X18999에 대사로 방문했던 리리나 피스크래프트는 자신들을 '마리메이어군'이라고 부르는 세력에게 납치되는데...