두꺼비 성운 58번 혹성 케론성으로부터 지구의 침략을 목적으로 군대가 파견되었다. 그 선발대로써 케로로 군단(케로로, 타마마, 기로로, 쿠루루, 도로로)의 5명의 병사로 이루어진 우주침공 특별군대가 지구로 오게 된다. 플래쉬판 케로로가 '케로로팝'이라는 이름으로 투니버스에서 방영되었다. '원작 탄생 15주년 기념 작품'이라는 사실이 밝혀졌다. 애니맥스에서 2014년 3월 22일에 1화를 방송하고, 플래쉬 기반의 3분짜리 숏 에피소드 형식으로 만들어졌다. 제목도 단순하게 '케로로'로 변경되었으며, 1화는 원작 1화에 해당되는 내용의 일부. 이후 진행 과정을 살펴보면 오프닝 포함에서 3분이라는 플래쉬 기반의 숏 에피소드 방식이라 엄청난 생략 과정을 보이고 있으며, 그 때문에 5인이 보이는 부분과 주변 인물들이 모이는 부분의 설명이 아무것도 없이 그냥 신등장때마다 짤막하게 소개만 하고 있다. 그리고 움직임은 부드럽지만 움직이는 장면은 생각보다 많지 않다. 1회부터 다시 시작하면서 원작 그림체에 가까워지도록 재조정되었으나, 기존 TVA의 설정을 폐기함과 동시에 원작 설정도 따라가지 않는 리부트 겸 오리지널 작품이 되었다.