Een karaktergestuurd politiedrama dat zich afspeelt in de Missing Persons Unit (MPU) van de politie van Philadelphia. Als de zoon van politieagent Nikki Batista vermist wordt, sluit ze zich aan bij de speciale eenheid om andere mensen te helpen hun dierbaren te vinden, zelfs als ze op zoek is naar haar eigen dierbaren. "Alert: Missing Persons Unit" is een procedureel drama met een bloedstollende zoektocht op leven en dood naar een vermiste persoon in elke aflevering, samen met Nikki en haar ex-man in hun zoektocht naar de waarheid over hun lang verloren zoon. Het is een case-of-the-week-show met een case-of-a-lifetime-verhaal dat er doorheen loopt.