New York, 1946: Agentin Peggy Carter kämpfte während des Krieges Seite an Seite mit Steve Rogers alias Captain America. Doch nach Ende des Krieges sieht sie sich beim Geheimdienst Strategic Scientific Reserve (SSR) zu einer besseren Sekretärin degradiert. Aber dann braucht Howard Stark dringend ihre Hilfe: Als einige seiner tödlichsten Erfindungen auf dem Schwarzmarkt auftauchen, wird er von der Regierung und der SSR des Hochverrats beschuldigt. Um seinen Namen reinzuwaschen, bittet er Peggy, die wahren Schuldigen zu finden und seine Waffen sicherzustellen.