Japan, späte Edo-Zeit. Die Erde wurde von einer außerirdischen Rasse namens Amanto annektiert, die technisch der Menschheit des 21. Jhds. weit voraus ist. Als Maßnahme zur Friedenssicherung wurden Japans Samurai entwaffnet. Einer von ihnen, Sakata Gintoki, schlägt sich nun als Gelegenheitsarbeiter durch und trifft dabei auf allerlei buntes Volk. - Schräge Abenteuer, ein mit Außerirdischen bevölkertes Japan und eine Gruppe aus Personen, die an den Wertvorstellungen der Samurai (mehr oder weniger) festhält, sind der bunte Mix, aus dem Gintama gemacht ist. Der Anime hat einen ganz eigenen Humor: Amüsant, respektlos und frech prügeln sich die Charaktere durch die Geschichte und nehmen gleichzeitig in einem chaotischen Mix aus Science-Fiction und Samuraigeschichte in jeder Episode ein neues Genre auf die Schippe.