La historia nos habla de un joven llamado Yamato Hibino, que es lanzado atrás en el tiempo, donde el ejército de dinosaurios del imperio Dragonia trata de dominar el mundo, y la reina Aira de Mu necesita a Yamato para que le ayude con el guardián de piedra God Mazinger, que parece sospechosamente un robot gigante. Su oponente es el emperador Dorado y su primogénito el príncipe Eldo. La serie está considerada como parte de la saga Mazinger, y no solo por su creador o nombre de la serie. Un libro japonés llamado Mazinger Bible, lanzado en 2002 por el 30º aniversario de la primera serie de Mazinger, incluye a God Mazinger dentro de la saga, entre otros.