La tercera entrega de la trilogía "Las chicas con pistolas" de Bee Train, El Cazador de la Bruja (español para "The Witch's Hunter") es la historia de una niña llamada Ellis, que se encuentra huyendo de los llamados Hunters of the underground. La sociedad por ser sospechosa de asesinato. Ella se encuentra con un cazarrecompensas llamado Nadie que le ofrece ayuda y orientación para buscar la verdad de su pasado. Pero ahora ella también está siendo atacada por los Cazadores y así comienza su búsqueda de la verdad.