Kurokami Medaka est élue comme Présidente du conseil étudiant alors qu’elle n’est qu’en première année de Lycée. Et pour cause, elle a mis à disposition une Boite à doléance (Medaka Box) dans laquelle les élèves peuvent y mettre leur requête et dont le conseil s’occupe d’y répondre. Avec l’aide de Zenkichi, Akune et Kikaijima, Medaka redonne un peu d’espoir aux élèves en détresse.