Dans le monde des Hackers, Takagi Fujimaru, étudiant en 2nd année au lycée faisant parti du club de journalisme, est connu sous le nom de "Falcon". Fujimaru se retrouvera mêlé à une affaire qui s'est produite suite à un massacre la veille de Noël en Russie. Ce virus est appelé "Bloody Monday". Il aurait été récupéré par une jeune femme mystérieuse nommé Maya. Falcon se servira alors de ses compétences pour pouvoir déchiffrer tous ces crimes.