L'umanità ha lasciato da tempo la Terra, trasferendosi nelle colonie spaziali orbitanti nella sfera terrestre. Nell'A.G. 101 però, un misterioso nemico, ribattezzato "UE" o "Unknown Enemy", attacca e distrugge la colonia Angel, in quello che verrà ricordato come "Il Giorno della Caduta degli Angeli", dando così via alla Guerra dei Cento Anni fra essi e la Federazione Terrestre. Otto anni dopo viene attaccata la colonia Ovan: il giovane protagonista di sette anni, Flit Asuno, perde nell'attacco la madre dopo aver ricevuto da lei l'"AGE Device", uno strumento tramandato nel casato Asuno e contenente i progetti di un potente Mobile Suit del passato conosciuto come "Gundam", il salvator