Il professor Komyoji è un genio della robotica viene tenuto prigioniero insieme a sua figlia Mitsuko dalla organizzazione criminale Dark, costretto a costruire dei Destructoid (mostruosi robot dall'aspetto di animali) per il leader dell'organizzazione, il malvagio professor Gill che mira alla conquista del mondo. Ma Komyoji con l'aiuto di Mitsuko costruisce in segreto un androide dalle sembianze umane, dotato di capacità straordinarie e capace di provare sentimenti grazie ad un circuito della coscienza installato dal professore chiamato Jiro (secondo figlio), creato ad immagine e somiglianza al primogenito deceduto dello scienziato. Jiro è stato creato per poter combattere i Destructoid di Gill e distruggere la Dark. Quando però Gill scopre il progetto di Komyoji, manda i suoi androidi soldato ad uccidere il professore e Mitsuko; questi ultimi però vengono difesi da Jiro. Durante la lotta scoppia un incendio nel laboratorio; Jiro riesce a scappare insieme a Mitsuko mentre Komyoji rimane disperso. Gill ordina al Destructoid Gray Rhino King(un rinoceronte antropomorfo) di rapire il fratello minore di Mitsuko, Masaru. Rhino King dopo aver catturato Masaru decide di usarlo come esca per tendere una trappola a Jiro ma la trappola fallisce ed il coraggioso androide preme dei pulsanti nascosti nelle sue spalle pronunciado le seguenti parole: Switch on, one, two, three! Fatto questo, Jiro rivela la sua vera identità di Kikaider, un androide dal corpo metà rosso e metà blu(questa colorazione è dovuta al fatto che il suo circuito della coscienza è incompleto) e sconfigge Rhino King dopo un breve combattimento. Dopo questa battaglia, Jiro parte alla ricerca del Prof.Komyoji che nel frattempo vaga solitario soffrendo di amnesia.