舞台は千年後。世界は見渡す限り砂漠が広がり、1万メートルもある巨大な樹木が至るところに立ち並び、人類は日々滅亡へと近づいていた。人々は人を介護したり、遊んだりできる、社会を構成する一員として造られたアソボット（アソシエートロボット）とともに暮らしていた。 少年サンゾウの父が開発した、アソボットの生命ともいえるAiプログラムにある男がコンピューターウィルスを不正に組み込んだ。そのウィルスはアソボットたちを「狂死病」へと導くものだった。自称最強最悪のアソボット・五九は、永い時間を越えてコールドスリープから目覚めたサンゾウと運命に導かれるように出会う。そして五九やサンゾウたちは不思議な力をもつハーモニカを持って、ウィルスを除去するための果てしない旅に出る。目指すは太陽が生まれる地、東の果てジパングだ！