배경은 2036년. 20년 전 2016년에 간토 일대를 담당하는 민영 전력회사 신토전력이 늘어나는 전력 소비를 감당해 내기 위해 도쿄만의 오다이바에 원전 4기를 건설 했지만 대지진이 일어난 바람에 방사능이 널려있게 되었다. 간토 일대는 전멸... 일본의 수도는 코토로 옴기게 되고 죽음의 도시가 된 도쿄는 봉쇄. 코펠리온이라는 유전자 조직에 의해 영상을 받지 않는 세명의 여고생들은 이송되어 오게 되는데...