댐 건설 당시 우연히 발견된 수수께끼의 유물 '아티팩트'를 연구하기 위해 설립한 국제연합 쿠로베 연구소. 세계 각국의 지식인들이 모인 연구소원의 자녀들이 다니는 타테야마 국제 고등학교에는 연구소장의 딸 시라하네 유키나도 다니고 있었다. 때는 2016년 여름. 한 명의 사무라이가 다시금 눈을 뜬다.