A missão de Naruto é capturar uma ninja desertora chamada Mukade. Ele a persegue e depois a detém nas ruínas históricas de Ôran. O objetivo de Mukade acaba sendo um dos pontos de um alinhamento de locais, perdido entre as ruínas; ele libera o poder dele, causando uma luz que envolve Naruto e a envia quase 20 anos antes do início da série. Quando Naruto acorda, ele entra em contato com o quarto Hokage, seu pai, Minato Namikaze.