Tudo começou quando Nevado cavou um buraco no jardim. Shin Chan, encontrou uma carta do período Sengoku correspondente a 1574. Depois de ler foi teletransportado para esse tempo. Lá ele encontrou um samurai que salvou a sua vida. Ele também faz amizade com os ancestrais de seus amigos Masao, Kazama, Boo-Chan e Nenê.Uma vez Shin Chan desaparecido, os pais começam a procurar maneiras de viajar de volta para resgatá-lo.