El anime comienza con Wendy teniendo un sueño sobre Peter Pan rescatándola y teniendo una pelea de espadas con el Capitán Garfio. Wendy y sus dos hermanos más adelante en el episodio van a la tierra de Nunca Jamas y Wendy se convierte en la "madre" de los Niños Perdidos. Durante el transcurso de la serie un romance florece entre Peter y Wendy mientras pelean con los piratas. La segunda mitad de la serie va a una dirección diferente a la línea de la historia original y también introduciendo un nuevo personaje (La Princesa Luna), que se convierte en una parte importante de los últimos episodios.