El Fantasma de Elena cuenta la historia de Eduardo (Segundo Cernadas), un joven millonario y atractivo, y la hermosa y encantadora Elena (Elizabeth Gutiérrez), que se conocen cuando ella lo rescata tras haber sufrido un accidente de auto. Mientras Elena lo ayuda a recuperarse se enamoran perdidamente. Sin embargo, cuando Eduardo lleva a Elena a vivir a su mansión, ella se encontrará con una serie de personas, ruidos y presencias que se dedicarán a hacerle la vida imposible.