El mundo está siendo atacado por los misteriosos monstruos espaciales gigantes "Víctimas" enviados para destruir a Sión y a todos sus habitantes. La única defensa de Sión son las cinco mechas sensibles de las Diosas, cada una unida a su propio piloto y reparador. Con una alta rotación de pilotos, depende de la Academia de la Diosa (GOA) entrenar a los candidatos jóvenes con habilidades de talento (llamado EX) para que algún día se conviertan en piloto de una Diosa. Candidato # 88 - Zero se acaba de unir al GOA y pronto se desarrollan misterios y secretos profundos y oscuros entre Zero, los pilotos y candidatos, y la Diosa Ingrid mientras las Víctimas presionan su ataque.