Yuji es un estudiante de secundaria al que se la diagnosticado un virus incurable. Decide someterse a un prolongado sueño artificial con la esperanza de que la tecnología médica sea capaz de tratar su enfermedad en un futuro. Año 2013, Yuji se despierta en su cámara de sueño... la Tierra esta dominada por los Blue, una raza de criaturas gigantes que son capaces de comer cualquier cosa, incluso los humanos... La Humanidad ha sido exiliada al espacio y trata de recuperar su planeta con los avanzados armour shrikes; unos vehículos de combate humanoides capaces de destruir a los Blues. Yuji está en medio de una guerra que no comprende, una lucha por la supervivencia de la raza humana en la que él jugará un papel muy importante...