La trama se basa en la existencia de dos mundos Sylvarant y Tethe'alla Estos originalmente eran uno pero tras una gran guerra un héroe desidio separarla y mediante el uso de las organizaciones "los desianos" y la iglesia de Martel, creo un ritual de regeneración del mundo. Sin embargo, este ritual solo sirve para uno de los mundos, y para que uno prospere el otro debe deteriorarse.