Martin Mystère, 16 ans, travaille comme agent spécial dans le « Centre », une organisation secrète spécialisée dans les phénomènes paranormaux. Il enquète souvent, en compagnie de sa demi-sœur Diana Lombard et de Java des Cavernes, dans les endroits très étranges, mystérieux et effrayants où se trouvent des créatures inimaginables.