악당 그루가 고아 세 명 마고, 에디스, 아그네스를 입양한 후 그의 삶에는 많은 변화가 생겼어요. 이제 그의 삶은 범죄를 저지르는 대신 잠자리 이야기, 아이들의 생일 파티, 소녀들의 첫 구혼자를 중심으로 돌아갑니다. 그러던 어느 날, 비밀 악당 연맹의 요원 루시가 그루를 본부로 데려가면서 그루의 새로운 삶은 갑자기 혼란에 빠지게 됩니다. 그곳에서 그루는 새로운 악당으로부터 세상을 구해야 하는 임무를 부여받습니다. 그루는 열심히 일을 시작하고 네파리오 박사와 평소에는 서투른 미니언들의 도움을 다시 한 번 받아요. 하지만 새로운 임무와 입양한 딸들을 키우는 일을 조화시키는 것은 쉽지 않고, 루시가 일 밖에서도 그루를 매우 좋아한다는 사실도 외톨이였던 그루에게는 너무 큰 부담입니다.