무토 카즈키는 평범한 고등학생으로 어느날 우연히 괴물에게 공격받고 있는 소녀를 구해주다가 심장을 빼앗기고 목숨을 잃고 만다. 그런데 거짓말처럼 다음날 멀쩡하게 살아난다. 알고보니 카즈키가 구해준 소녀가 심장 대신 연금술 연구의 성과인 핵철을 심어줘서 새생명을 얻게 된 것이다. 괴물의 정체는 호문클루스로 사람을 잡아먹는 괴물이다. 이에 카즈키는 토키코와 함께 호문클루스에 대항하여 고통받는 사람들을 구하려고 하는데......