Takuya Arima é um jovem estudante cujo pai, um historiador que conduziu várias pesquisas, desapareceu recentemente. Durante as férias de verão, Takuya recebe um pacote peculiar de seu pai desaparecido, juntamente com uma carta contendo informações sobre a existência de vários mundos paralelos. No início, Takuya não leva a sério, mas logo percebe que possui um dispositivo que lhe permite viajar para dimensões alternativas. Afinal de contas, seu pai está vivo? Se sim, onde ele está?